甲状腺T3、T4的降低，在排除了实验室的干扰因素后，可能是甲状腺功能减退。甲状腺功能减退是各种原因导致甲状腺激素水平合成及释放水平的下降，从而引起的低代谢综合征。从发生部位来说，分为原发性的甲状腺功能减退症、继发性的甲状腺功能减退症。
原发性的甲状腺功能减退症是指发生在甲状腺本身的疾病，包括自身免疫性甲状腺炎。继发性的甲状腺功能减退症是甲状腺手术、药物、缺碘，还有颈部放射性治疗损伤甲状腺，造成甲状腺病变，引起T3、T4水平的下降。
具体病因监测或确定时，要进行其他项目检测，包括病史询问、TSH水平测定，及TPO、TGAb、TRAb抗体水平的测定，以及甲状腺B超的检测等。如果T3 、4水平下降同时，促甲状腺水平也下降，就要考虑垂体或下丘脑病变，进行垂体等核磁水平的检测。
