肛门瘙痒在临床上比较多见，其发生的原因多数与肛周的基础疾病有密切关系，比如肛瘘、肛周息肉以及痔疮等疾病，均可以导致肛门关闭不全。肛门在关闭不全以后，直肠、肛管内的分泌物会通过肛门流到肛门外，引起肛周的湿疹和瘙痒。因此为了治疗瘙痒，积极治疗原发病是唯一的治疗手段。

肛瘘等感染性疾病较难自然愈合，而且由于肛瘘有外口，会反复、长期出现黏液渗出，明显刺激肛周皮肤，形成局部的湿疹和瘙痒。对于肛瘘的治疗，只有将瘘管彻底的切开，使新生肉芽组织由内向外生长，随着肛瘘的愈合，局部的瘙痒感才会消失。