射精过后小便刺痛最常见于前列腺炎、尿道炎、后尿道结石等，建议应及时到泌尿外科就医。具体原因如下：
1、前列腺炎：病人发生慢性前列腺炎时，由于感染性致病菌刺激前列腺部尿道黏膜引起黏膜水肿、糜烂，还会引起前列腺腺体发炎，导致腺管和腺体发生炎性肿大。另外感染性致病菌还会波及射精管开口，引起输精管发炎，导致精液感染。在射精时由于致病微生物刺激后尿道糜烂的黏膜，病人就会出现后尿道刺痛症状，出现射精后小便刺痛症状；
2、尿道炎：尿道炎的病人由于感染性致病菌刺激尿道黏膜，引起黏膜水肿、糜烂。在射精时由于精液刺激糜烂的尿道黏膜，会引起尿道出现刺痛症状，部分病人还会出现尿道灼热症状；
3、后尿道结石：后尿道结石的病人由于结石划破后尿道黏膜，导致黏膜破损，在射精时，由于精液刺激破损的尿道黏膜，也会出现射精后尿道疼痛症状。
