尿道感染一般由致病的病原体感染引起，尤其是男性尿道感染，最常见的为淋球菌，即淋病双球菌，第二种为沙眼衣原体，第三种为解脲支原体，以上三种病原体是造成男性尿道炎最常见的三种病原微生物，其表现各不相同，主要病因是性接触。
病原体不同则其潜伏期也不一样，如淋球菌引起的尿道感染潜伏期一般为3-5天，表现为尿痛、尿道有分泌物、尿道口红肿，其分泌物可能为黄色，也可能为白色的脓性分泌物，量较多且可能有腥味，尿疼且尿道分泌物非常多等。
如果表现为尿痛、尿道口红肿、有黏性、黏液性的分泌物，则可能是沙眼衣原体或解脲支原体感染引起。三种病原体微生物感染都需要做检查。
如淋球菌可以直接涂片或染色，观察白细胞里是否存在淋病双球菌，其它两种病原体目前比较快捷的办法主要是查核酸，采用聚合酶链式反应(PCR)做核酸检测，如淋球菌、沙眼衣原体、解脲支原体的核酸，如果核酸阳性则基本可以明确诊断。
淋球菌、沙眼衣原体或解脲支原体造成的尿道炎和尿道感染，应进行相应的抗生素治疗。
