泌尿系统包括肾上腺、肾脏、输尿管、膀胱、尿道，男性还包括前列腺、阴囊、睾丸、附睾以及男科的疾病。因此只要这些器官发生问题，都是泌尿外科的治疗范畴。由于泌尿系统疾病是大外科当中一个分支，系统含的器官较多，因此疾病也较多。

如肾上腺，主要是肾上腺的肿瘤，包括良恶性的肿瘤；肾脏有肾脏的结石、肾脏的肿瘤、肾脏的囊肿等；输尿管主要有输尿管的结石，或者输尿管的肿瘤；膀胱，如膀胱癌、膀胱过度活动症、腺性膀胱炎、间质性膀胱炎、神经源性膀胱，以及膀胱出口梗阻等；尿道，包括尿道的狭窄、尿道的先天性疾病比如尿道下裂、尿道炎，包括泌尿系的炎症，如尿路感染，都是泌尿系统的疾病之一。

男科或者男性方面所特有的疾病，如前列腺炎、前列腺癌、前列腺增生等。如睾丸的肿瘤或者附睾的肿瘤，以及附睾的炎症，都是泌尿外科的疾病。男科的疾病，如精索静脉曲张、早泄、勃起功能障碍、弱精症、无精症、少精症等，都归泌尿系统疾病。泌尿系统疾病还有一些炎症或者先天性的疾病，比如泌尿系的结核、先天性的泌尿系畸形，都是泌尿系疾病。