引起呼吸困难和咳嗽并在夜间发作，最常见的疾病是支气管哮喘。

支气管哮喘是一种以嗜酸粒细胞浸润为主的慢性的气道炎症，它的症状以喘息、气急、胸闷、咳嗽为主要表现，而症状夜间发作更为明显，是哮喘的一个特征性症状，夜间发作可以是喘息、胸闷导致呼吸困难、咳嗽。

支气管哮喘症状还可以被诱发因素所诱发，例如吸入冷空气、接触花粉、吸入花粉、闻异味、呼吸道的病毒感染等,支气管哮喘通常要到医院做支气管激发试验或气道可逆试验才能够确诊。

为了进行鉴别诊断，首先要做的是胸部影像学的检查即胸片或者胸部CT，一旦出现晚上总是胸闷，气短、咳嗽的情况，一定要到医院做进一步检查确定疾病，才能够使疾病得到有效治疗。