病理活检最重要的意义是做出明确的诊断，给临床进行指导和治疗提示。常见的医学书上会提到病理医生是医生的医生，病理诊断是金标准。
虽然金标准并不是完全意义上的金标准，但对目前的诊断和治疗来说，病理诊断是非常重要的依据。比如胃肠镜活检是否能提示癌前病变，宫颈组织活检等都是发现恶性病变的最好方式。此外，如果确定为恶性病变，切除下来的手术标本也必须做病理组织学检查，病理报告中给临床各种提示信息，比如肿瘤类型、分级、范围、累及到周围器官情况等，对临床治疗、预后都起到非常重要的指导作用。
随着目前分子病理的发展，结合分子基因检测，病理活检能更好地实现金标准的作用。
