流产的原因包括很多种，大部分流产是由于染色体异常，发生率约50%。第一次发生流产，多数是由于胚胎的染色体异常，这是一个自然淘汰的过程，和准爸爸准妈妈没有相关性。如果明确不是胚胎染色体异常，准爸爸准妈妈要进行检查。准妈妈方面可能与内分泌异常、黄体功能不足、甲状腺功能异常以及自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮等有关，还有先天性子宫畸形、纵隔子宫和宫腔粘连等也可能会导致孕早期的流产。孕期的不良生活习惯也可能会导致流产，如抽烟、喝酒或晚睡、晚起等。此外，孕早期叶酸的缺乏也可能会导致神经管畸形、早孕期流产。准爸爸的不良生活习惯也会导致流产，多数导致流产的类型是长了一个空孕囊而没有长胚芽。建议男士在准备怀孕期间，应该有规律健康的生活作息，避免烟酒等可避免流产的发生。
