癫痫手术不是每个病人都能够百分之百达到完全治愈，原因主要有以下几种：
1、患者的病灶范围超过手术安全切除范围。为避免严重的功能损害，在手术切除时可能残留一部分癫痫病灶，影响手术疗效；
2、在术前可能发现主要病灶，但实际上可能在主要病灶之外还有潜在病灶。只是在术前评估时并没有被很好的表现出来，当切除主要病灶若干年以后，患者因为潜在病灶也会逐渐演变发展，成为引起癫痫复发的病因；
3、患者进行姑息手术，如神经调控治疗或离断手术以后发现姑息治疗本身针对的就是多灶弥漫性放电的癫痫患者。这种姑息手术其实也只能降低发作频率、减轻发作程度、减少发作次数，所以术后也有少部分病人可能有发作情况。而大部分病人通过手术治疗还是能够达到很好的效果。所以真正手术效果不好的患者其原因多种多样，不能因为术后复发就否认手术对于癫痫治疗的价值。
