DPP-4抑制剂主要的副作用，其实是指上呼吸道的感染，包括鼻窦炎、鼻炎，还有牙龈感染，主要集中在上呼吸道，包括中耳炎，风险确实比其他的高，但是不会致命。另外的副作用可能是皮肤皮疹，包括过敏。相比而言，可能因为大多数药物可能是胃肠反应，但是DPP-4抑制剂，可能是皮肤病变、皮疹、过敏、上呼吸道感染，这种比例相对会比较高。

另外一部分的不良反应或者副作用主要集中在头痛，有些人可能会出现头痛。所以基本上都是集中在上呼吸道、头部的不良反应，和其他胃肠不良反应不同。可能有些人会出现转氨酶升高，这个比例相对不是很高，因为这类药主要作用在肠道，就是抑制血中的GLP-1的代谢，抑制、破坏酶的活性。因为GLP-1主要是作用在肠道，所以有些患者，如果本身有胰腺炎或者胰腺的病变，这类药物不推荐使用。

所以DPP-4抑制剂的主要的副作用，是上呼吸道的感染，如鼻窦炎、鼻炎、中耳炎，以及牙龈炎。另外就是皮疹或者皮炎、头痛，还有肝区不适，或者转氨酶升高。另外有一部分，如果有胰腺炎，不推荐再使用。