所有的颅咽管瘤都是良性的。但是从形态来说，颅咽管瘤主要分三类，第一部分是由肿瘤细胞构成的实性肿瘤。第二部分是，肿瘤的一部分是实质性的肿瘤细胞构成，另部分是囊性的，是囊液。第三部分肿瘤是由实质性的、囊性的以及部分钙化的肿瘤构成，所以肿瘤成分多种多样。但是所有的颅咽管瘤都是良性。所以颅咽管瘤有囊性的、实质性的，还有钙化的。肿瘤的性质不一样，对周围组织的影响也不一样。比如囊性的颅咽管瘤，虽然肿瘤很大，但是它对周围组织的影响可能会小一些，包括压迫视神经。实质性的肿瘤压迫视神经会比囊性的肿瘤压迫视神经引起的症状要重。换句话说，囊性的颅咽管瘤对周围组织的压迫作用小。
