长期吞痰是不好的习惯，痰中的细菌、病毒等病原微生物以及其炎症代谢产物，一起进入消化道，如食道、胃肠道等，可能在消化道里产生炎症。如果痰里有结核分枝杆菌，吞痰动作就会使呼吸道的分枝杆菌进入消化道，可引起肠结核、胃结核等消化道结核。如果本身胃有溃疡、有炎症，吞入的炎症介质则不利于消化道炎症愈合。

所以不建议长期吞痰，痰液应及时咳出，并放入装有消毒液的专有容器，没有容器时，可用纸巾包住，进行后续处理。如果怀疑痰中有结核杆菌，建议焚烧纸巾，这是最理想的一种消毒方式。