男性生殖系统体格检查主要以触诊为主，医生用手触诊睾丸、附睾、精索以及阴茎，也可通过直肠指诊方式触诊前列腺，即可将男性生殖系统器官全部检查到。触诊睾丸时，建议采取直立位，在室温下将裤子褪到膝盖以下，医生用手分别触诊两侧阴囊进行比较，如两侧睾丸大小、软硬度、附睾情况等，以及有无精索静脉曲张。对于中老年人，也可通过直肠指诊明确前列腺情况，如前列腺大小、软硬度、有无压痛及结节等，也可按压前列腺取前列腺液进行化验、检查。

体格检查的内容，通常需要根据男性要求及可能考虑的疾病进行选择，通过体格检查可初步排除或寻找到部分病因，为后续深入检查提供依据。如果发现患者存在精索静脉曲张，可再进行B超检查。如果发现前列腺可能存在异常，可进行PSA、前列腺B超甚至核磁检查等，进一步判断病因。