儿童右肾囊肿的危害主要根据囊肿的大小及有无并发症确定。单个小囊肿一般不存在危害，多发大囊肿可能有压迫、出血、感染，甚至肾功能不全的危害。儿童单纯肾脏囊肿发展缓慢，一般不会随年龄增长而急剧增大，对体检时B超或CT发现的肾囊肿，一般无症状，不需要特殊治疗。囊肿直径＜4cm且无症状的患儿建议定期复查，部分囊肿可能不断增大，压迫肾实质，导致肾实质萎缩，肾功能受到影响。
如果患者伴有腹痛、血尿、高血压、囊肿增大、感染，或囊肿直径＞5cm，可在B超引导下行囊肿穿刺术，注入无水乙醇等治疗。部分患儿存在多囊肾，比较危险，但一般发生在双侧，初期不一定有任何症状，但随疾病进展可能出现出血、高血压，大部分会进展为终末期肾病、肾衰竭，需要透析治疗。
