尿液呈现咖啡色通常有多种原因，常见如下：

1、泌尿系肿瘤：通常见于中老年人群，表现为无痛性肉眼血尿。出血在膀胱内停留一段时间，所以被氧化成咖啡色，患者需全面进行泌尿系B超、CT检查，必要时做膀胱镜和尿道镜检查，以早期发现肿瘤。如果能切除，通常采用以手术为主的综合治疗；

2、泌尿道结石：尖锐的结石划破泌尿道黏膜，造成尿路出血。所以除典型肾绞痛外，患者可能会出现出血情况。如果血液在膀胱停留时间较长，可能会呈现咖啡色外观；

3、泌尿系感染：经典症状尿频、尿急、尿痛，此时尿道黏膜处在充血、水肿、糜烂、溃疡状况，也有出血可能，可被氧化成咖啡色；

4、少见疾病：比如溶血性黄疸，需关注患者肝脏功能以及近期内科相关病史。