男性出现阴茎根部疼痛，见于以下情况：

1、急性前列腺炎：男性出现阴茎根部疼痛最常见于急性前列腺炎，病人发生急性前列腺炎时，由于感染性致病菌刺激前列腺黏膜，导致前列腺部尿道黏膜水肿、糜烂，会出现前列腺腺体肿大、疼痛症状。前列腺位于尿道阴茎根部，会出现阴茎根部疼痛症状；

2、尿道炎：阴茎根部疼痛还见于尿道炎病人，病人发生淋菌性尿道炎时，会导致尿道黏膜出现水肿、糜烂，会出现黏膜破损，出现水疱、脓疱。水疱、脓疱破裂后会形成脓性分泌物，病人还会出现尿道刺痛，尿道刺痒或尿道口分泌物，多数病人还会出现阴茎根部疼痛症状。

病人出现上述症状时，需及时到泌尿外科或男科就医，通过分泌物检查，常常能找到致病微生物。通过选择有效的抗生素，如盐酸米诺环素，配合八正胶囊联合治疗，多数病人阴茎根部疼痛症状会明显好转。