俗话说是药三分毒，从这方面看，肯定是吃药危害更大。因为药吃到肚子里，经过吸收、消化，再起作用，在身体里循环一遍后才被排泄出来。而雾化，虽然吸入后在支气管、咽部或者肺的表面起作用后，也会被吸收一部分，但是大部分还会被呼吸道排出，所以从这方面看，雾化的危害应该会相对更小。
但是如果选药不正确，雾化也一样会出现一些问题，比如雾化时抗生素选用不当，其实现在不是特别建议一定要用抗生素做雾化治疗，用抗生素做雾化是很容易诱导耐药，会导致将来需要吃抗生素时效果不好。所以雾化时不能随意选药，应该到医院由医生选择。
另外，雾化时有时会用化痰药、激素或者盐水，如果处理不当，比如盐水放置时间太久导致浓度过高，或者是化痰药，会刺激气道黏膜引发排痰效应或者咳嗽加重，这时在医师的指导下应用比较好。吃药更是这样，一定要准确用药。
