慢性结肠炎的主要表现是腹泻，临床上多诊断为肠易激综合征、功能性腹泻等。而肠易激综合征腹泻型或者功能性腹泻，以泄泻为多，临床上以脾气虚弱、脾阳不振、脾肾阳虚为主要表现的情况比较多。临床上脾气虚的多采取参苓白术丸治疗；如果是肝郁脾虚，多采取痛泻要方来治疗；如果是脾肾阳虚、肾阳不足，多采取四神丸来治疗。

这些患者查肠镜可能没有特殊表现，或者是在乙状结肠、直肠，有一些轻微的黏膜充血、红斑等，内镜室大夫会有可能诊断为慢性结肠炎。实际上是一种功能性肠病，不同于一些炎症性肠病，比如溃疡性结肠炎、克罗恩病，它是不相同的。所谓的慢性结肠炎，大部分都指功能性肠病，一般以肠易激综合征，或者功能性腹泻比较多一点。