脑干梗塞是否在第5天就会发生病危，需要视梗塞的部位来定，还有是否合并有大血管病变。如果是供应脑干的大血管有比较严重的狭窄，在急性期又没有给予很好的干预，随着病程进展，累及延髓的时候，可能在急性期内会出现病危的症状。
脑干梗塞在急性期，尤其是发病的首2周内都有一定风险。风险的大小视脑干梗塞的部位以及病程进展来定，脑干梗塞如果发生在中脑和脑桥部位，通常会影响眼球运动和说话，出现面瘫以及肢体瘫痪。
延髓是生命的中枢，心跳和呼吸中枢都在延髓。如果脑干梗塞的部位发生在延髓，或者脑干梗塞在急性期没有得到较好的处理，随着病程进展，病变部位累及延髓，此种情况是比较危重的。患者可能会突然出现呼吸、心跳骤停，而出现急性死亡。
