纵隔子宫容易增加胎儿畸形的风险，但并不是胎儿一定会畸形。纵隔子宫是先天性的子宫畸形，子宫腔内有一个纵向的隔膜将子宫分为两部分。
这个隔膜会阻碍受精卵着床发育，导致胚胎发育异常，还会减少子宫可用的空间，使胚胎的生长和发育受到限制，容易导致胎儿肢体发生异常。
如果胚胎着床在纵隔上，还会影响胚胎的血液供应，导致胚胎得不到足够的营养，会影响胎儿的正常生长发育。纵隔子宫由于空间比较小，也容易导致胎儿的胎位异常，如臀位、横位，会增加分娩风险。
当然并非所有的纵隔子宫，孕妇都会出现胎儿畸形，因为发生胎儿畸形的原因非常多，主要与胚胎质量有关，有纵隔子宫的孕妇如果有复发性胚胎停育或者复发性流产等，在排除其他因素以后，可以行子宫纵隔切除术。
