肠镜检查需要的时间可长可短，快的可能是几分钟，3-5分钟，10分钟左右都有可能，慢的可能需要几十分钟，40-50分钟这样的状态。影响肠镜检查时间的因素有几种，第一跟医生的水平有关系，如果是熟练掌握肠镜检查技术的医生，检查很快，而且在检查过程当中，患者的不适感不会太明显。

其次跟患者的肠道准备有关，如果肠道准备得不好，肠道当中有很多蛋花样大便，甚至成形便，影响医生的肠镜检查的视野，影响进镜，这时也会影响肠镜检查的时间。另外要强调，如果有少量的成形便可能还好。如果有大量吸水便，这时肠道蠕动过快，肠镜在进镜过程当中反复地注气来清空视野，肠道会越来越胀，反而会影响到肠镜检查。另外，肠蠕动过快也会影响到视野。

另外肠镜检查的因素就是解剖结构，本身就有过大的异常问题。在肝曲和脾曲这两个位置上，位置过高，通过有障碍，以及乙状结肠和直肠交界的地方弯曲过大，这时肠镜通过这个交界处以后也有障碍，这种情况下也会影响到肠镜的检查时间。