尿路感染通常采用药物治疗，如口服左氧氟沙星或三金片，通常大概在3-7天，症状可以得到明显缓解。但需要继续服药到症状消失、排尿正常以及尿常规正常的情况下，才可以考虑酌情停药。
因为泌尿系感染，可能会反复迁延不愈，甚至会继发逆行上尿路感染，引起膀胱炎或者肾盂肾炎，尤其是对于局部抵抗力比较弱的老年人或者孕妇，以及可能存在着泌尿生殖系统病变，如泌尿生殖系统的畸形、肿瘤、结石、异物、损伤等病变的情况下，其尿路感染容易反复发作。
对于合并多种疾病引起的反复泌尿系感染，在治疗感染、控制症状的同时，还要处理泌尿系统的原发性疾病，只有原发疾病得到控制，感染才能避免反复发作。
在临床上药物的选择，可以根据经验选用，如氧氟沙星等喹诺酮类药物，或者头孢类、青霉素类药物，也可以根据药敏结果，选择合适的抗生素进行针对性治疗。
