头以下胸以上是颈部，颈部核磁共振能看到颈部组织结构。一般颈部用核磁做，关心的是两个内容，首先为颈椎，核磁对于颈椎的椎间盘、脊髓、椎管、神经根的压迫都很好。
其次是甲状腺和甲状旁腺，甲状腺和甲状旁腺对于人体而言是两个较重要的内分泌器官，甲状腺大小、功能，包括形态都会有变化，比如严重的甲状腺癌可以用核磁来看，甲状腺更多的是良性结节。但是唯一的问题是核磁从目前而言相对较昂贵，该设备未普及，患者对核磁图像的解读不熟悉，尤其是没有看见过的，解读起来麻烦，所以限制其应用，核磁没有B超简单、方便、快捷、实时。
