射精功能障碍的病因主要分为射精过度与射精缺乏两大类，其中包括心理性因素、器质性因素、内分泌因素、动力学因素等。
一、主要病因
1、射精过度：
（1）年轻时过多出现性行为。
（2）担心性行为损害健康，女方不愿意进行性生活，要求快速结束性行为。
（3）性生活频数过少或长时间性压抑者，担心性行为失败而焦虑，可形成条件反射性快速反应。部分早泄由器质性因素所引起，如神经系统疾病(脊髓肿瘤、多发性硬化症、癫痫发作或大脑皮质器质性病变)，下尿道及生殖器炎症等。
2、射精缺乏：
（1）内分泌因素：如Kallnmann综合征(低促性腺激素性性腺功能减退，伴有嗅觉减退或嗅觉缺失)、Klinefelter综合征(克氏综合症又称原发小睾丸症或曲细精管发育不全)、先天性无睾症、双侧睾丸切除术后和双侧睾丸扭转等。
（2）生殖系统疾病因素：如严重双侧精囊炎、先天性精囊缺如和先天性双输精管缺如等，各种病因引起的膀胱颈松弛，以及梗阻性病因，如尿道狭窄等，由于尿道梗阻使排精阻力增加，精液反流入膀胱。
（3）药物性因素：如采用雌激素治疗的前列腺癌病人。
（4）神经系统异常：大脑功能异常对射精中枢抑制性加强，腰骶髓内射精中枢和勃起中枢功能紊乱或衰竭等。
二、诱发因素
1、性生活间隔时间较长：性行为的快慢与间隔时间有关，间隔时间过长会导致早泄。
2、疲劳时性行为：当工作后、劳累时性行为可引起射精功能障碍。
3、性生活时过度紧张：多见于新婚时性行为，过度紧张可导致射精功能障碍。
4、夫妻感情不融洽时性生活：夫妻感情生活不融洽时，可出现性生活时紧张，诱发射精功能障碍。
5、自卑时性行为：怀疑自己性能力时容易导致早泄。
6、纵欲过度：长期纵欲过度可引起神经兴奋性增高，导致性生活时过于兴奋，发生早泄。