结石的形成是过饱和溶液析出晶体的过程，就像是浓盐水放置以后，杯底会析出盐的晶体，同样的尿液也是过饱和溶液，在一定条件下就可能同样析出固体的物质，就是所谓的结石。可以简单从促结石形成的因素和身体预防结石形成的手段失效两方面，来分析结石形成的原因，具体如下：
一、促结石形成的因素，有感染、喝水少，以及代谢性疾病等因素，具体如下：
1、感染：有两种化学成晶方式，一种叫有核成晶，一种叫无核成晶，有核成晶更加容易，泌尿系结石绝大多数是这种类型，而晶核多半是细菌的尸体、炎症代谢的废物，或者脱落坏死的细胞等等，一些无机盐及有机物围绕其形成了结石，因此泌尿系感染、炎症等可能导致结石。
2、喝水少：尿液浓度过于饱和、梗阻导致的尿液瘀滞，就像流水不腐的原理，容易导致结石，预防的方法最可控也最容易的就是增加饮水量，尿量的增加是最有效的预防结石发生或复发的手段。
3、代谢性疾病：比如高钙血症等，都有可能会促使结石的形成。
二、身体预防结石形成的手段失效，有枸橼酸盐代谢异常、解剖因素，以及输尿管梗阻等，具体如下：
1、枸橼酸钠代谢异常：它能够使尿液呈一种过饱和状态，而不使得晶体从尿液中析出，有些先天性枸橼酸代谢异常的患者就容易长结石。
2、解剖因素：比如说肾集合管汇集成肾乳头形成肾小盏，一些炎症可能改变导致局部形成涡流，在这种不规则的流体力学的状态下，结石也同样容易析出生成。
3、输尿管梗阻：正常的输尿管蠕动应该非常顺畅，尿液能够顺畅的排出，如果出现梗阻导致尿液的瘀滞，就容易引起结石。
简单来讲就是两方面，促结石的因素及身体预防结石形成的手段失效。从部位来讲，有肾结石、输尿管结石、膀胱结石、尿道结石，其中绝大多数结石是原发于肾脏，输尿管与尿道的原发结石非常少见，因为主要作用是尿液的输送，而膀胱结石多见于下尿路梗阻的患者，同样为尿液淤滞引起。