炎症性肠病的临床表现呈多样化，包括消化道表现、全身性表现、肠外表现和并发症，主要表现为腹泻、腹痛、里急后重等症状。
一、典型症状
1、腹部症状：
（1）腹泻：血性腹泻是溃疡性结肠炎最主要的症状，粪中含血、脓和黏液。轻者每日2~4次严重者可达10~30次，呈血水样；克罗恩病腹泻为常见症状，多数每日大便2~6次，糊状或水样，一般无脓血或黏液，与溃疡性结肠炎相比，便血量少，鲜红色少。
（2）腹痛：溃疡性结肠炎常局限于左下腹或下腹部，阵发性痉挛性绞痛，疼痛后多有便意，排便后疼痛暂时缓解；绝大多数克罗恩病均有酸痛性质多为隐痛，阵发性加重或反复发作，部位以右下腹多见,与末端回肠病变有关，其次为脐周或全腹痛，餐后腹痛与胃肠反射有关。少数首发症状以急腹症手术，发现为克罗恩病肠梗阻或肠穿孔。
（3）里急后重：因直肠炎症刺激所致。
（4）腹块：腹块部分克罗恩病可出现腹块，以右下腹和脐周多见，由于肠粘连、肠璧和肠系膜增厚、肠系膜淋巴结肿大所致，内瘘形成以及腹内脓肿等均可引起腹块。
（5）肛门症状：克罗恩病偶有肛门内隐痛，可伴肛旁周围脓肿，肛痿管形成。
（6）其他表现：有恶心、呕吐、食欲缺乏等并发症引起的临床表现。
2、全身症状：
（1）贫血：常有轻度贫血，疾病急性暴发时因大量出血致严重贫血。
（2）发热：急性重症病例常伴有发热及全身毒血症状，1/3 克罗恩病者有中度热或低热，间歇出现，为活动性肠道炎症及组织破坏后毒素吸收引起。
（3）营养不良：肠道吸收障碍和消耗过多，常引起患者消瘦、贫血、低蛋白血症等表现。年幼时患病者伴有生长发育迟缓的表现。
（4）肠外表现：包括口腔、眼部、皮肤、肝胆、骨关节、泌尿、血液系统都可出现相关病变。
二、其他症状
1、可有腹胀、食欲不振、恶心、呕吐等。
2、肠外表现包括外周关节炎、结节性红斑、坏疽性脓皮病、巩膜炎、葡萄膜炎、复发性口腔溃殇等。