原发性腹腔妊娠极少见，其发生原因不明，但腹腔上皮有可能转化成副中肾管上皮，特别是腹腔或盆腔内有异位的子宫内膜存在，而使受精卵着床、发育成原发性腹腔妊娠。继发性腹腔妊娠绝大多数发生于输卵管妊娠破裂或流产后，妊娠物自破裂部或伞部排出。但部分仍贴于患部，种植部的绒毛存活并依附于附近的腹膜或脏器继续发育而成为腹腔妊娠。
一、主要病因
1、原发性腹腔妊娠：受精卵原发种植于腹膜的确切原因不明，有学者认为腹膜由体腔上皮衍生而来，具有潜在的副中肾管上皮的功能，子宫后壁常有蜕膜反应即可证实。腹腔或盆腔腹膜表面有异位的子宫内膜存在，更有益于受精卵着床、发育成原发性腹腔妊娠。
2、继发性腹腔妊娠：
（1）输卵管妊娠破裂或流产：胚胎从破裂处或伞端排入腹腔，但部分绒毛组织仍附着于原着床部位，而继续得以血供，胎盘组织则渐渐由破损处向外生长，附着于盆腔腹膜及邻近器官表面，胚胎继续生长发育，而形成继发性腹腔妊娠。腹腔妊娠由于胎盘附着异常，血液供应不足，胎儿不易存活至足月。 
（2）卵巢妊娠：卵巢妊娠是指受精卵在卵巢内着床和发育，当卵巢破裂时，可导致胚胎落入腹腔中。
二、诱发因素
1、盆腔炎症性疾病  ：盆腔炎症可以引起输卵管粘连、变形、瘢痕形成、蠕动障碍和内膜损伤，并呈不可逆性，并且慢性盆腔炎尤其输卵管炎，可干扰受精卵正常运行。
2、子宫内膜异位症  ：为受精卵着床提供土壤。 
3、既往盆腔手术史  ：可导致输卵管受牵拉变，部分精子仍能通过，但如受精卵运行受阻，停留在输卵管内则发生输卵管妊娠，破裂流产后可出现腹腔妊娠。 
4、长期放置宫内节育环：长期放置宫内节育环可使官腔内膜损伤缺氧，许多人阴道流血时间长，为细菌的上行感染创造了条件，加上本身潜在感染因素，增加了盆腔炎发生机会，从而增加了异位妊娠的发生率。 
5、流产  ：大部分研究结果显示，流产次数以及流产史与异位妊娠呈正相关，尤其是存在流产史妇女，可能发生异位妊娠的几率远远高于未流产妇女。