吉林医药学院附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的大型综合性医院，坐落于风景秀丽的吉林市松花江南岸。医院原为解放军第四六五医院，始建于1952年，1996年被总后卫生部批准为“三级甲等”综合性医院，2004年8月27日随第四军医大学吉林军医学院整体移交吉林省政府管理并更名为吉林医药学院附属医院。
医院占地面积4.4万平方米，医疗教学用房5.8万平方米，开设42个业务科室，床位715张；全院在职人数1130人，其中，副高级职称以上201人。2021年，医院吉林地区率先引进德国原装进口西门子Force双源高端CT，并常规配备核磁共振、128层螺旋CT、DSA、大型生化分析仪、胎儿四维超声诊断系统、奥林巴斯腹腔镜系统及电子胃肠镜、体外冲击波碎石机等大型设备218台(件)。
医院现为吉林市城镇职工基本医疗保险定点机构，低保定点单位，吉林市区域医联体核心医院，吉林市异地就医医疗定点单位，吉林市工伤定点医院，吉林地区规模较大的血液透析中心，吉林市口腔科、皮肤科、感染控制科、疼痛科、肾病学专业质控中心。同时承担着吉林医药学院临床医学院、药学院、检验学院、公共卫生学院、护理学院、管理学院等9个学院23个专业的全部临床教学任务和部分实习任务。
医院先后被认定为国家临床教学示范中心，国家级住院医师规范化培训基地，卫生部医疗质量优胜单位，助理全科医生培训基地、全科医生转岗培训基地、美国心脏学会心血管急救培训中心、计划单列联合培养硕士研究生学科单位、基层医疗卫生人才培养教育研究基地；临床医学专业为国家特色专业、吉林省首批品牌专业建设点、吉林省特色高水平专业A类、吉林省一流专业建设点，通过教育部临床医学专业认证(有效期6年)。外科学团队为省首批黄大年式教师团队，吉林省首批虚拟教研室建设项目——外科学虚拟教研室完成验收。
医院拥有心血管疾病介入诊疗，妇科内镜诊疗，口腔种植诊疗，血液透析治疗四项省级限制医疗技术。妇产科、口腔科为吉林省重点专科，糖尿病及其并发症实验室为省重点实验室，中药质量检测实验室为省中医药管理局二级实验室，疼痛科、腔镜治疗专科为吉林市重点建设专科，血液透析中心为吉林市特色专科，泌尿外科、骨外科、心血管内科为院内重点专科。临床医学学科为吉林医药学院校级重点建设学科。获评国家疼痛专业医疗质量控制中心首批哨点医院，国家级银屑病规范化诊疗中心，全国临床药师学员培训基地，创建吉林市老年友善医疗机构。神经内科获批吉林市名科创建单位，获批吉林市医学会神经病学分会青年委员会主委单位。
医院先后获评吉林省先进基层党组织、吉林省三八红旗集体、吉林市模范集体、吉林医药学院“三全育人”工作先进集体、吉林市卫生系统“三好一满意”活动先进医疗单位等，连续六年获得吉林省“价格诚信单位”。
2020年、2022年，医院先后两次作为吉林市新冠肺炎集中定点救治医院，在国家、省、市卫生行政部门的坚强领导下，院领导班子带领全院职工快速响应，迅速行动，周密部署，科学救治。新时代新征程，吉林医药学院附属医院将紧紧扭住公立医院高质量发展的重点任务，凝心聚力，服务人民，建设高水平的现代化人文医院、智慧医院、平安医院。