上海交通大学医学院附属第九人民医院感染科，始建于1980年，历任科主任徐伯忠、王功大，经过30余年的建设与发展，已经成为集医疗、教学与科研为一体的综合性三级甲等医院的专业科室。
感染科（含发热门诊）目前有临床医师16人，其中主任医师1人，副主任医师4人，主治医师4人，住院医师7人，退休返聘医师6人，护理人员24人。2016年12月6日，上海第九人民医院感染科大楼重新装修后正式启用，整个病房开放床位50张，包括普通肝病病房、经典感染性疾病隔离病房，感染性疾病普通内科病房，并设立重症监护病房（床位5张）。
2004年成为上海市住院医师规范化培训中心，2009年经CFDA审核批准建立肝病药物临床基地，近几年负责或参加了多项国际国内多中心临床研究。每年专科门诊约50000人，每年出院近1600人，病种齐全，可保证药物临床实验的病人来源，建立门诊病人信息库，标本的收集和参加医院样本库的建设，目前已初具规模血清标本2万余份，组织标本200余份。
2002年许洁主任在以色列特拉维夫大学医学院做访问学者期间发现传统意义上的“传染科”已不能代表国内外感染性疾病发展的趋势，无法满足病人的需求，因此，近十余年感染科再次朝着建设“感染病科现代版”努力奋斗，以建立适应感染疾病谱变化和与国际趋势接轨的专业科室、培养拥有细菌真菌感染和抗菌药物应用知识和能力的专业人才、“让中国的复杂难治感染患者，能与肿瘤或心肺疾病等一样，得到专业对口的感染病科的病区收治”。
除了收治细菌和真菌引起的各类感染，感染科还要承担院内外各类疑难感染性疾病会诊，同时参与医院感染预防与控制；参与抗菌药物临床应用管理；开展感染病诊疗和抗菌药物合理应用的培训和科普宣传。并在院内协助其他科室的抗感染诊治中起到了重要的作用，能够作为兄弟科室的后盾也是感染科的重要责任。
在新型感染性疾病的诊治的同时，感染科仍在传统肝病的诊治上追求进一步的发展，为Ⅱ期临床药理实验室、宝山区感染性疾病诊治指定医院，开放肝病专家门诊、自身免疫性肝病专科门诊，保持了对传统的肝病的诊治优势，同时顺应疾病谱的变化对肝癌、肝硬化（各类并发症）、酒精性肝炎、脂肪肝，药物性肝炎的病人进行收治，特别开设了自身免疫性肝病专病门诊。在加强多学科合作方面，感染科在2016年开始组建肝病多学科诊治中心，多次邀请相关专家进行疑难病例讨论，并定期召开学术交流会议，给患者提供系统的、个体化的治疗。
“雄关漫道真如铁、而今迈步从头越”，感染科在医院的支持下，在全科室共同努力下，在新的病房开始新的征程，为更多的病人提供更优秀的服务。
