江苏省第二中医院外科，技术力量雄厚，人才梯队健全，长期以来为无数患者解除了病痛。除开展各种类型的外科手术治疗以外，还善于运用中西医结合治疗、免疫治疗、微创治疗、内镜治疗及各种支持治疗为患者提供服务。
外科现设如下专科：
甲状腺专科：对甲状腺癌、甲状腺瘤及炎症等各种甲状腺肿采用中西医结合治疗，并兼顾整形，疗效显著。
乳腺专科：在治疗常见的乳房疾病，如小叶增生、纤维腺瘤等方面能得心应手，疗效显著。在乳腺疑难杂症的治疗方面有独到的诊断和治疗方法。治疗主要采用中西医结合方法，同时结合微波治疗仪、外敷药物等辅助治疗方法，大大提高了治疗效果。外科还开展了乳房畸形的矫形手术。
肝胆脾胰专科：该专科已在肝脏、胆道手术方面积累了丰富的经验，在术后并发症的防治方面有独到之处，尤其在胆囊炎、胆囊结石的治疗中，采用不同术式，并配合研制的药物（省级科研用药），具有疗效好、疗程短、预后佳、费用低等优点。在治疗胆管炎、胆管结石、胆道畸形、胆囊癌、胆管癌以及肿瘤或结石等原因所致的黄疸、急慢性胰腺炎、胰腺肿瘤、肝硬化门静脉高压症、肝肿瘤、脾肿瘤、脾破裂、脾功能亢进症等疾病方面有丰富的经验，先进的腹腔镜手术更使胆道疾病的手术达到了微创效果。
胃肠专科：开展各类胃肠肿瘤、溃疡、出血、梗阻的手术及内镜治疗，同时开展胃肠道各类外科疾病的中西医结合治疗。
泌尿专科：诊治各种泌尿系感染疾病、前列腺疾病、性功能障碍、男性不育、泌尿系结石及肿瘤、尿道狭窄等均有独到之处。进口碎石机的使用更是减轻了泌尿系统结石患者的痛苦。
肛肠专科：肛肠科采用本院研制调配的多种疗效独特的内服外用药物，开创了许多独特的治疗方法。主治内痔、外痔、混合痔、肛裂、肛乳头痛、肛周脓肿、各型肛瘘（尤其是复杂肛瘘）、肛管肛窦炎、肛肠肿瘤。具有治疗过程中痛苦小，病灶痊愈时间短之特色。特别是近期开展了无痛手术，疗效好，零痛苦，深受广大患者欢迎。
肿瘤（外科）专科该专科技术力量雄厚，擅长消化道肿瘤、乳腺肿瘤等各种手术治疗。且根据不同部位、不同体质患者的情况，拟定手术或非手术的最佳治疗方案，特别在术后采用先进药物进行全身化疗、腹腔灌注化疗、免疫治疗，同时配合祖国传统医学加以治疗，对控制病情变化，提高机体免疫力，延长生命，提高患者生存质量有独特的疗效。经治肿瘤患者的远期生存率（5年以上）已达80%。
