首都医科大学附属北京儿童医院眼科为拥有专业门诊、病房、医技检查、验光配镜中心、弱视训练、视感知觉治疗工作室为一体的综合性儿童眼病诊疗中心，同时为北京市残联指定残疾评估、康复中心，并托管北京儿童医院保定医院、北京市顺义区妇幼保健院、北京儿童医院郑州医院、北京儿童医院新疆医院、北京儿童医院黑龙江医院。
有医护技人员共80人，其中医生33名，其中教授、博士生导师1名，副教授、硕士生导师3名，有博士学位31人。视光技师及弱视训练师13名，护士34名。
目前眼科设有斜弱视、神经眼科、角膜病、眼整形、泪道病、青光眼、白内障、眼底病、眼肿瘤等专业。北京儿童医院及托管医院眼科共有病床49张，年均手术量5700余例，其中内眼手术约1300例，每年接诊来自全国各地的眼病患儿约27.8万人次。在小儿斜弱视、近视、泪道疾病、眼整形、儿童角膜移植、眼肿瘤、眼底病筛查及治疗、视神经疾病、遗传性眼病、青光眼白内障诊治、微创玻璃体切割手术及角膜塑形镜、儿童RGP镜片及特种眼镜验配等方面积累了丰富的经验。
开展的特色诊疗项目包括特发性眼球震颤等复杂斜视的手术治疗及发病机制研究，儿童及婴幼儿角膜移植手术，儿童眼球震颤及白内障术后个性化视觉功能重建，早产儿视网膜病变的综合诊治，Ritleng泪道插管手术、微创泪道重建术、鼻内窥镜鼻腔泪囊吻合术等治疗复杂儿童泪道疾病、利用GORE-TEX新型材料进行额肌悬吊术治疗儿童上睑下垂，先天性小睑裂综合征微创手术，视网膜母细胞瘤的个性化综合治疗，360°微导管引导下小梁切开术治疗先天性青光眼等。
目前可以完成婴幼儿、儿童、青少年视觉电生理、视网膜电图、视野、OCT、眼部彩超、UBM、IOL-master、角膜地形图、角膜内皮镜、眼震电图、婴幼儿视力检测及屈光筛查、新生儿Retcam广角数字眼底检查、3D人机交互视觉信息检测等特殊眼科检查，弥补了很多大型三甲医院无法做儿童眼科检查的遗憾，检查仪器设备及技术水平居国内领先水平。
在教学方面，承担首都医科大学7年制儿科系的教学任务，承担每年来自全国各地基层小儿眼科进修医师的培训工作。举办多次国际、国内学术会议及国家级、市级小儿眼科继续教育学习班。
在科研方面，获得包括2项国家自然科学基金在内的20余项国家级、省部级课题资助，在国内外专业期刊上发表论文上百篇，其中SCI收录论文数十篇，获得国家发明专利多项，在中华医学会眼科学分会、中国医师协会眼科医师分会、中国妇幼保健协会儿童眼保健专业委员会、美国视觉与眼科学会等国内外多个重要学术团体中有学术任职，多次参加国内外学术交流，多批次外派学术带头人、中青年骨干、年轻医生在国内外进修学习。
同时积极参加各种公益活动，连续举行全国性大型公益项目“爱目行动”，每年进行爱眼日系列科普宣传活动，应国家及北京市卫健委邀请每年进行多场近视防控科普讲座，多次赴西藏、青海、甘肃、湖北、四川等地及京津冀地区进行扶贫、眼病筛查及义诊活动。
