中南大学湘雅二医院普外科胃肠学组组建于1958年，随着医疗科技的迅速进步，2000年重新调整学科，建立胃肠外科，是国内较早成立胃肠专科的单位之一。
主要开展对胃肠道肿瘤进行手术为主的综合治疗及腹部良性疾病、普外常见疾病的手术治疗，业务范围包括胃癌、胃十二指肠溃疡、肠梗阻、肠瘘、结肠癌、直肠癌、阑尾炎、先天性胃肠畸形、门脉高压症、上消化道出血、下消化道出血、腹外疝以及痔瘘疾病等。胃肠外科现任学科负责人赵华。
现有正高6名，副高4名，共医护人员40余人。均受过普通外科和肿瘤治疗、护理的严格训练。科室有专业床位85张，配有先进的电子胃肠镜、腹腔镜、超声刀、力确刀、痔疮治疗仪等设备，每年收治胃肠道肿瘤及普外手术近一千八百例。是湖南省胃肠外科床位数最多、专业技术力量最强的单位。
胃肠外科紧跟国际胃肠肿瘤治疗的最新动态，以根治肿瘤、延长病人生存期和提高肿瘤病人生存质量为目标，一直坚持肿瘤治疗的标准化、规范化和个体化原则，在国内及省内肿瘤外科界占有很重要的地位。
科室已开展各类胃肠肿瘤手术上万例，包括胃癌、结肠癌、直肠癌、胃肠间质瘤、胰十二指肠肿瘤、小肠肿瘤等的手术；在胃肠肿瘤规范根治方面处于国内先进水平，如D2、D3胃癌根治、结肠癌规范根治、直肠癌全系膜切除及保肛手术等。70年代后期开始了低位直肠癌的超低位保肛手术，采用术前放化疗结合双吻合方法进行直肠癌超低位吻合保肛，使得直肠癌的保肛率达到85％以上，距肛门4-5M的直肠癌也能获得保肛。
科室近年的结直肠癌平均5年生存率在60％以上，达到国内同类医院的最好水平。科室是GIPAP医学评估中心，在胃肠间质瘤治疗方面具有丰富的经验。
在恶性肿瘤辅助治疗方面，坚持多学科协作，在国内很早开展了国际标准化的新辅助化疗和术后辅助放化疗，明显提高了术后病人的生存期；建立健全随访制度，对术后病人全身及局部情况进行评估，及时发现术后疾病复发及进行处理。
湘雅二医院普通外科胃肠科的腹腔镜微创治疗也是该科室一大治疗特色，在省内率先开展了腹腔镜下胃癌、结直肠癌根治术、腹腔镜内镜联合治疗胃肠良性疾病、腹腔镜辅助联合脏器切除、腹腔镜减肥术等复杂腔镜手术。术后病人创伤小、胃肠功能恢复快，效果显著。现已累计病例700余例，积累了丰富经验，在国内处于领先地位。
湘雅二医院普通外科胃肠除了肿瘤的治疗，科室在腹部良性疾病治疗方面也有其独特之处。在对胃十二指肠溃疡、腹腔腹膜后软组织肿瘤、食道胃底静脉曲张、脾功能亢进、肠息肉、肠梗阻、肠外瘘、腹外疝、切口疝、大肠炎性疾病并发症、先天性腹部疾病、痔、肛瘘、肛裂、严重便秘等疾病的外科治疗具有丰富的经验。
如对于门静脉高压症科室近年来开展改良的分流加断流的方法，有效地控制了术后再出血率。在肠瘘的治疗上，采用开展静脉营养与肠内营养结合、肠液收集回输等方法，使肠瘘治疗的难度降低，治愈率得到提高，所报道的方法在国内处于先进水平。在国内较早地开展人工材料修复腹外疝和腹腔镜疝修补使腹外疝手术后生活质量得到极大提高，复发率明显下降。
在最为常见的痔疮治疗上，采用不同的治疗方法有效组合，如传统的注射治疗、手术切除和超声刀手术、PPH治疗等相结合，取得了显著效果。科室配备专职造口护理师对肠道造口病人进行精心护理和随访。
湘雅二医院普通外科胃肠在学术、科研方面，科室参加多个国内、国际的随机、多中心治疗研究项目积极参加和主持国内外、省内外的肿瘤、普外会议和学术活动。近年来共获部省级课题成果多项，在国际及国家级期刊上发表论文上百篇，主编《消化外科学》、《十二指肠外科》、《肛肠外科手术学》、《胃肠外科学》等多部胃肠专著。
