华中科技大学同济医学院附属同济医院小儿外科初建于1950年，由我国著名小儿外科专家童尔昌教授创建，是我国除北京、上海最早在全国性综合性教学医院成立小儿外科专业的第三家医院。
现专科有固定床位58张，每年收治病人1800人次左右，床位使用率95~125％，年门诊量达35000人次，手术量1900~2200人次，手术及诊治疾病覆盖小儿普外、新生儿外科、小儿泌尿外科、小儿骨科等专业，并设有全国唯一的小儿巨结肠与便秘门诊。
小儿外科研究室已具备进行各类研究的基本条件，有大型仪器设备多项，如多功能测压仪（适用小儿食道、直肠、泌尿系的各种测压）、手术显微镜、小儿腹腔镜、深低温冰箱、垂直电泳仪、冰冻切片机等。创建至今，本院小儿外科始终保持国内领先地位，在诊疗和科研水平上不断发展创新，一些领域已与国际接轨，综合实力十分雄厚。
小儿普外及新生儿外科在对小儿慢性顽固性便秘、先天性巨结肠、巨结肠同源性疾病的研究和诊治方面处国内领先水平，历史悠久，经验丰富，并设有全国唯一的巨结肠门诊。
王果教授发明的“巨结肠根治心形吻合术”全国数十家省市医院采用，效果良好，并发症少，并开展了新生儿巨结肠根治术、经肛门巨结肠根治术、腹腔镜辅助下巨结肠根治术、短段型和超短段型的内括约肌部分切除术，收治的病人来自全国各地。
另外对先天性胆总管囊肿、胆道闭锁、新生儿消化道畸形、各种肿瘤及小儿外科各种疑难杂症方面均有丰富的经验，在全国处于领先水平。近年来还先后开展小儿腹腔镜辅助下的阑尾切除、胆囊切除、梅克尔憩室切除和巨结肠根治手术。
小儿泌尿外科在先天性尿道下裂、先天性肾积水、肾盂输尿管各种畸形及肾母细胞瘤等疾病诊治水平处于全国领先和先进水平。先天性尿道下裂的一期成形术成功率达到世界先进水平，并开展了后腹腔镜肾上腺肿瘤切除术、重复肾切除术及高位隐睾探查术等先进术式，创伤小，恢复快，效果好。
小儿骨科对先天性发育型髋脱位和先天性马蹄内翻足针对不同年龄及病情分别采取不同术式，矫正效果好，并发症少；特别是髋脱位的改良蛙式石膏固定法，既保证了复位固定的可靠，又减少了关节僵硬等并发症，患儿痛苦少，便于生活护理，深受欢迎。对各种瘤样病变采用刮除加同种异体骨植入，安全、可靠、复发率低。
各种骨缺损，运动系统畸形及创伤、肿瘤、感染的治疗也独具特色。手术治疗结合康复锻炼和扶助器具的应用，使得病人术后矫正及恢复快，效果佳，体现了综合医院治疗的优势。
近年来，本科还开展了小儿腹腔镜手术，手术仅需在腹壁作几个0.3-0.5cm的小洞，因此也有人称之为“钥匙孔”手术。传统的外科手术需要在病人身上作一相当长的切口来显露手术的区域和病变器官，对病人损伤大，切口疤痕影响美观，也可能发生切口感染、切口裂开、切口疝、肠粘连等并发症。
腹腔镜手术具有创伤小、出血少、痛苦少、恢复快、伤口感染机会极少、腹部美容及腹腔内粘连少、术后家属陪伴护理的强度小等特点。目前腹腔镜能完成的手术已超过60多种，随着医学技术水平的发展，腹腔镜手术正逐步取代许多传统手术。
本科是中华小儿外科杂志（本专业最权威的中文学术期刊）的主编单位，现任主编袁继炎教授是我国著名的小儿泌尿外科专家。本科还是我国小儿外科学教材的主编单位之一，并先后主编小儿外科专著10余部。
近几年承担了国家自然科学基金课题五项，教育部、卫生部课题三项，省科委、省卫生厅课题三项，研究领域遍及小儿外科各个领域，研究成果多次获卫生部、湖北省及武汉市奖励。
本科还是我国最早具有小儿外科博士授予权的单位，目前有博士导师三名，硕士导师六名，先后培养儿外专业博士、硕士研究生50余名，多人已成为我国小儿外科的骨干。
此外，本科年接收小儿外科专业实习的本、硕、博教学200人次，本科生、七年制硕士班大课授课总学时达65学时，年接受省内外专科医师进修学习10余名，德国海德堡大学和乌尔姆大学的医学生也定期来本科实习。
本科有一半的医师从德国、美国、瑞士等国学习回国，他们带回了国外的先进技术，有效提高了本科临床与科研水平。与此同时，本科还与美国、德国、英国、澳大利亚等国的小儿外科同行有密切联系，并多次邀请国外专家来本科讲学、示教，国际交流日趋活跃。
