哈尔滨医科大学附属第二医院病理科成立于1961年，六十年多来，经过几代人的努力，科室在医疗、教学、科研等领域取得了长足的发展，成为省内一流病理科。科室拥有先进的制片、诊断、教学及科研设备。已实现从接收标本开始到病理报告发出全过程计算机管理，全部实现高质量的图文病理报告，受到广大临床医生的欢迎。近年来年科室年常规工作总量(包括手术切除标本、活检、术中冰冻、细胞学)近8万例，其中外院会诊近2千例。
除常规HE切片外，科室还开展免疫组化，特殊染色，宫颈液基细胞学检查及原位杂交、分子病理等检查项目。在消化道肿瘤、肺癌、乳腺癌、淋巴瘤、泌尿系统肿瘤、神经系统肿瘤、软组织及骨组织肿瘤等病理诊断领域具有诊断优势，各亚专科专家多人参与国内或行业多个病理诊断或肿瘤诊治专家共识与指南的制定。
科室现有工作人员39人，其中医师24人，技术员15人。医师中教授及主任医师5名，副主任医师7人，主治医师10人，住院医师2人。其中拥有博士学位9人(其中3人在国外取得学位)，硕士学位14人，博士后3人，博士后流动站在站1人，博士研究生在读4名。目前科内医生和技术员都具有独特的本专业的工作能力，人材梯队建设已初见规模，形成一支技术力量很强的病理学诊断专业队伍。
科室现有博士生导师1名，硕士生导师3名。承担研究生、进修生和轮转医师的教学任务，培养硕士、博士研究生近30名，研究生答辩成绩优秀率达100%。在培博士研究生3名。每年招收来自省内外的进修学生20余名，共招收进修学生500余名，为省内培养了大量的病理专业人才。
此外，病理科实行一专多能型的工作方式，各个亚专科病理都有专家提供权威的诊断意见。科内每天都进行典型病例、少见病例、疑难病例的带教工作，并定期参加医院的多学科讨论。同时科里每年举办不同形式的外科病理医师进修班、疑难病理诊断及病理新进展学习班等。
科室公开发表论文140余篇，被国外SCI收录的70余篇，其中国内核心期刊70余篇；科室人员承担的国家及省部级课题30余项；参与出版论著近20部。
近年来，在院领导的支持下，病理科有了很大的发展，制定了10年长远规划，病理科致力于提高质量，随着医院现代化进程的加速，希望病理科亦能得到一定得发展，病理科全体工作人员必将为哈医大二院的发展做出更大贡献！
