甲减起病缓慢，症状繁多且不特异，临床很容易被误诊为下列疾病：

1、慢性肾炎：甲减病人因水钠潴留表现为颜面水肿、皮肤苍白、贫血、血胆固醇升高，有些病人还伴有尿蛋白阳性，所以通常被认为是慢性肾炎。但甲减患者通常血压不高，肾功能正常，一般无血尿及大量蛋白尿，而甲功减低；

2、特发性水肿：甲减病人的成纤维细胞分泌的黏多糖在皮下过多积聚，可引起黏液性水肿，通常因症状不特异，易被误诊为特发性水肿。与特发性水肿不同，黏液性水肿为非指凹性水肿，且患者甲功减低；

3、抑郁症：甲减病人发生在老年人中较多，老年病人症状不特异，病程进展缓慢，不容易被发现。怕冷、迟钝、食欲不振、情绪低落、睡眠不好和抑郁等症状，可能会被诊断为老年性抑郁症；

4、垂体瘤：长期甲减病人，尤其是儿童患者，垂体可以表现增大，有时会被误诊为垂体瘤。原发甲减长期血T4下降，垂体细胞增生肥大，导致蝶鞍增大，一些女性病人由于月经紊乱和泌乳，实验室检查发现催乳素轻度升高，被误诊为垂体催乳素瘤；

5、低T3综合征：临床上一些急、慢性重症患者或晚期肿瘤恶液质病人，可出现血游离T3(FT3)下降，称为低T3综合征，常被误为甲减。但这类患者的血游离T4(FT4)一般正常，有时可稍下降或升高，血清反T3(rT3)升高，TSH正常，可资鉴别。