根据甲状腺自身抗体阳性，可以诊断为自身免疫甲状腺炎，但是要想诊断为桥本甲状腺炎还需要加一个条件，即甲状腺肿大。临床上可以通过甲状腺触诊或甲状腺超声来判断，若甲状腺增大，则为经典的桥本甲状腺炎。若甲状腺无明显增大，有可能是萎缩性甲状腺炎。

桥本甲状腺炎起病隐匿，进展缓慢，多数患者以甲状腺肿或甲减症状就诊。当患者出现甲减后，可有怕冷、心动过缓、便秘、甚至黏液性水肿等表现。

桥本甲状腺炎作为常见的自身免疫甲状腺炎，临床特点是甲状腺内有大量淋巴细胞浸润，在外周血中有针对甲状腺抗原的自身抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体。还有些患者会存在促甲状腺激素受体抗体，TRAb又可以分为TSAb、TBAb，若TRAb阳性，临床表现为甲减，则考虑TRAb为阻断性抗体TBAb，若表现为甲亢，则为刺激性抗体TSAb。

TPOAb和TgAb滴度明显增高是最具有意义的诊断指标，可持续数年或数十年。研究表明甲状腺内的淋巴细胞浸润程度与血清中的抗体滴度具有紧密的相关性，因此，通过血清中TPOAb和TgAb阳性诊断自身免疫甲状腺炎。