脑干肿瘤的病因包括基因突变、先天因素、情绪不稳定、家族遗传和化学因素，具体如下：
1、基因突变：脑干胶质瘤以儿童较多发，多与基因突变相关，成年患者多与免疫相关；血管母细胞瘤或血网病因不明确，可能与基因突变相关。
2、先天因素：海绵状血管瘤为非真性肿瘤，是一种特殊的血管畸形，多与先天因素相关。
3、情绪不稳定：中医认为此病多由于惊恐或大怒，或衰哭忧郁，使气血流行失常，抵抗力减弱，病邪乘虚而入，发为癌瘤。
4、家族遗传：在疾病发生与发展过程中，家族遗传因素包括家族成员聚集性倾向、家族成员的家族遗传性疾病，都会对肿瘤的产生与发展起到一定的影响作用。
5、化学因素：后天因素比如严重的颅脑创伤，后天生活环境、习惯、工作环境以及长时间接触致癌性的化学物质，都有可能造成肿瘤的发生与发展。
