如果怀孕40天不想要，要尽早到医院计划生育科进行流产，包括药物流产、人工流产。药物流产是通过吃药将妊娠的胚胎排出，人工流产是通过机械的方法，将胎儿从子宫腔内取出，可以根据自身需求，选择合适的流产方式。

1、药物流产：一般在怀孕49天内进行，目前可以使用米非司酮和米索前列醇，一共分3天用药，前2天服用米非司酮，不需要在医院服用，回家服用即可，第3天服用米索前列醇，此时必须要在医院服药，一般在服药6个小时左右，即可将妊娠物排出。当有出血，有东西掉出来时，一定要让医生检查，看其是否完整排出，当医生检查以后才能够离开。药物流产好处是没有宫腔操作，坏处是药流以后的出血时间和出血量较多、较长。

2、人工流产：通过使用负压吸引器的办法，将胚胎吸出。女性可以选择无痛流产的方式，在流产过程中使用麻药，一般使用量较少，在流产结束以后即可清醒，流产过程中没有疼痛的感觉。人工流产缺点是有宫腔操作，可能会增加子宫内膜损伤的机会，也会增加感染机会，好处是解决问题较快，一次性即可解决。

流产后2周内不能同房、洗盆浴，由于人流手术后宫颈口比较松弛，阴道内有血液，而血液是细菌的培养基，如果此时同房或洗盆浴，容易导致细菌上行感染，造成盆腔炎等疾病。还要注意不吃辛辣、油腻，以及冰冷的食物，如辣椒、大蒜、雪糕等，避免抽烟、饮酒。