鼠疫的症状主要是发热以及淋巴结肿大。临床上鼠疫分为腺鼠疫、肺鼠疫、败血症鼠疫以及轻型鼠疫。鼠疫的主要表现为发热，患者起病急剧，寒战、高热，体温骤然升至39℃-41℃，常稽留热。
患者会出现剧烈头痛，有时出现中枢性呕吐、呼吸急促、心动过速、血压下降。重症患者早期即可出现血压下降、意识不清、谵妄等。可以出现腺鼠疫以及肺鼠疫。腺鼠疫最为常见，除具有鼠疫的全身表现以外，受侵犯部位所属的淋巴结肿大，为其主要的特点。
好发部位依次为腹股沟淋巴结、腋下、颈部及颌下淋巴结，多为单侧。淋巴结肿大与发热同时出现，表现为迅速弥漫性的淋巴结肿胀，典型表现为淋巴结明显触痛而坚硬，与皮下组织粘连，失去移动性，周围组织显著水肿，可有充血和出血。
由于疼痛剧烈，患者常呈被动体位，肺鼠疫根据传播途径不同，肺鼠疫可以分为原发型，和继发型两种临床类型。
