虽然腭隐裂仍然属于腭裂，但在治疗模式上，和一般的腭裂还是有很大区别。对于腭隐裂的患儿，国际惯例是等到患儿2-3岁，开始发音并能说出较为丰富语句时，经过语音评估后，确认有腭咽闭合不全的表现，再去进行手术，即此时是腭隐裂患儿的治疗时机。而对于未表现出功能异常的腭隐裂患儿，可暂时进行严密的监护，当出现喂养或语音等问题时，可考虑对腭隐裂进行手术修复。
其实腭隐裂手术时机会晚于常规腭裂时间，是因为有40%-50%的腭隐裂患儿，其实不用做修复手术。这部分患儿虽然腭部肌肉有异常，但是肌肉力量很好，其吞咽和发音完全正常，和普通人基本一致。而一部分的患儿的肌肉比较弱，才需要手术重建腭部肌肉，恢复正常的功能。
所以说，不是所有的腭隐裂患儿都需要手术，腭咽功能正常、发音完全正常的患儿，就没有进行腭裂手术的必要，过度医疗不符合医学伦理。就算是软腭或者悬雍垂形态上存在问题，平常不会别人盯着孩子嘴巴里面看软腭的外形，只要功能正常就不必担心。剩余需要手术的腭隐裂患儿，及时实施手术，也可以完全恢复正常功能，不必过于担心。
