抗焦虑药物的副作用通常会出现一星期左右。尤其是服用舍曲林、氟西汀、氟哌噻吨美利曲辛片、帕罗西汀等抗焦虑的药物，最常见的副作用是胃肠道反应，比如恶心、呕吐、口干、口苦、上腹部不适、腹痛，也有可能会出现进食不好、食欲下降、腹泻、便秘等一系列的问题。也可能会出现中枢神经系统的副作用，比如头晕、头痛、嗜睡等，也有可能会出现血压不稳、心情烦躁等副反应。
这些副作用通常在服药最开始的几天比较多见，超过一星期以后大部分都能自动消失，不需要特殊的处理和干预。但也有其它的副作用可能时间会比较长，而且需要特殊的干预。比如长期服用苯二氮卓类的抗焦虑药物，有可能会出现依赖性问题，这时需要及时进行干预。也有可能会出现肝肾功能损害的问题，尤其是长期服用以后肝功能异常，这时也需要立即进行处理，在医嘱的指导下考虑换药、减药或者停药治疗。
