停经40天阴道出血，在排除月经来潮的情况下，如果是月经不规律的女性或者排卵延迟的女性，在同房后40天阴道出血，存在着床出血的可能。但是，如果是月经正常的女性，不太可能是着床出血，可能为先兆流产或异位妊娠等表现，需根据孕妇的具体症状进行判断。

1、月经来潮：可能为女性月经来潮的表现，因压力、熬夜或其他原因导致月经紊乱，出现停经40天再次月经来潮的情况，可做相应检查，排除怀孕及其他病理可能；

2、孕囊着床：着床一般发生在同房后6-7天，最晚为10天，因此停经40天着床出血，只有月经不规律的女性或者排卵延迟的女性才有可能发生；

3、先兆流产：出血量较少，常为暗红色或为血性白带，伴有轻度下腹痛或腰背痛。如果为孕激素不足者，给予孕激素补充，积极控制基础疾病进行保胎治疗，经治疗后如果阴道流血停止，超声提示胚胎存活，可继续妊娠。如果临床症状加重，超声提示胚胎停育，表明流产不可避免，需遵医嘱及时终止妊娠；

4、异位妊娠：即宫外孕，典型症状为停经、腹痛、阴道流血，可伴有蜕膜碎片排出。患者需立即入院检查，一旦确诊，遵医嘱给予手术治疗，及时终止妊娠，以免症状加重，造成大出血，甚至发生失血性休克，危及生命。

若女性出现停经40天阴道出血，需监测血HCG、孕酮，必要时进行超声检查，了解是否怀孕及胚胎发育情况，若确定不是怀孕，则需遵医嘱行进一步检查，以排除其他疾病的可能。