巧克力囊肿是比较特殊的一种囊肿，会在卵巢内形成如同巧克力一般形态的囊肿，其发生率在众多的子宫内膜异位中大概占据了17%-44%的比例，如果不接受手术，会造成不容易怀孕。
首先，有1/3的不孕患者，大部分都是因为子宫内膜异位而导致的，而在患有了巧克力囊肿之后确实也不容易正常的怀孕，哪怕是在怀孕之后也会出现流产的风险，因为这种疾病会导致卵巢内的血管分布受到损害，也会降低卵巢对于性腺激素的反应导致卵子质量快速的下降，干扰卵子的受精着床。
其次，巧克力囊肿虽然说已经成为了一种不孕的因素，但是依然还是有人会怀孕，只是几率比较低，为保护女性的生育健康，目前的医学并不建议生育前接受手术治疗，建议采取药物保守治疗。
巧克力囊肿可影响生育，但在生育之前一般并不建议手术治疗巧克力囊肿，但是如若患者的巧克力囊肿已经超越了常规的标准，就必须要严密的定型检测，以免造成不孕症，患者必须要及时接受治疗。
