阿莫西林胶囊是口服广谱半合成青霉素类抗生素，在妊娠分级中属于B级，哺乳期药物危险分级为L1。阿莫西林胶囊的副作用有恶心，呕吐，腹泻及伪膜性肠炎等胃肠道反应；皮疹，药物热和哮喘等过敏反应；贫血，血小板减少，嗜酸性粒细胞增多，血清氨基转移酶可轻度增高等血液系统影响；由念珠菌或耐药菌引起的二重感染；偶见兴奋，焦虑，失眠，头晕以及行为异常等中枢神经系统症状。
因阿莫西林胶囊是口服广谱青霉素类抗生素，因此青霉素皮肤试验阳性患者禁用。传染性单核细胞增多症患者应用本品易发生皮疹，应避免使用。疗程较长患者应检查肝肾功能和血常规。有哮喘、枯草热等过敏性疾病史者慎用，老年人和肾功能严重损害时可能需调整剂量。
有文献报道出现皮疹没有及时处理导致大疱性皮肤松解型药疹，另有报道出现迟发性过敏反应，因此服药期间要注意药物不良反应，及时干预，随时就诊。
