如果出现肠梗阻，多数患者可以通过肠镜进行检查并明确原因。肠梗阻包括小肠梗阻和结肠梗阻，通常做肠镜检查前应尽量进行肠道准备。但对于肠梗阻，通过保守治疗仍达不到肠道准备条件，如果梗阻位置相对较低，也可以尝试进行肠镜检查，了解梗阻部位及原因。
肠镜可能无法了解部分肠梗阻的情况，因为可能达不到肠道准备条件。对于此类患者，如果通过保守治疗无效，甚至要进行剖腹探查或腹腔镜的腹腔探查。对于小肠梗阻，可以通过小肠镜或小肠造影了解小肠的梗阻部位和病变情况，但也有部分不能进行小肠镜检查，甚至也不能通过胶囊镜进行检查。
