慢性肾病治不好的原因，是肾脏出现不可逆的损伤。肾脏是一个成对的器官，每侧肾脏大概有100万个肾单位，肾单位又由肾小球和肾小管组成，肾小管又分为近曲小管、髓袢和远曲小管，所以肾脏是一个很精密的器官。
一旦肾脏出现不可逆损伤的时候，往往会合并纤维化，合并纤维化后，这部分肾脏就已经损坏，此种情况下，慢性肾病是一个逐渐进展的过程，再也不能恢复原状。对于如此精密的结构，不管用什么方法，都很难达到重建的目的。
另外，目前很多慢性肾病，其肾脏的病理损伤都不可逆，如肾小球硬化、肾小管萎缩，或肾间质纤维化等。针对这些情况，目前并没有有效的药物能够改善，这时通常预示慢性肾病无法彻底治愈，治疗的目的是让其进展慢一点。
