肿瘤标志物高的临床意义通常代表某些恶性肿瘤的存在可能，但在一些良性疾病也可以出现肿瘤标志物高，要注意鉴别。

肿瘤标志物是肿瘤细胞产生并且分泌到血液或体液中，而被检测到的蛋白质、酶类和代谢产物。当肿瘤标志物高的时候可能提示体内存在恶性肿瘤，比如甲胎蛋白增高往往提示原发性肝癌，或生殖腺来源的恶性肿瘤存在，癌胚抗原增高往往发生在肺腺癌、乳腺癌、胃癌、肠癌、胰腺癌的病人。

糖类抗原CA199增高往往发生在胃癌、肠癌、胰腺癌等病人，糖类抗原CA125增高主要发生在卵巢癌、输卵管癌、原发性腹膜癌的病人。这些肿瘤标志物升高后通常不能确诊恶性肿瘤，还要通过胃肠镜检查以及相关的影像学检查来发现病变，最终通过病理学检查才能够确诊。

良性疾病也会引起肿瘤标志物高，如慢性肝病中的肝炎、肝硬化。肾功能不全的病人以及慢性炎症性疾病也可以引起肿瘤标志物高，要注意鉴别。