避孕针是通过皮下孕激素的埋植，达到孕激素缓慢释放，从而达到避孕的效果。其主要的副作用，是长期的孕激素缓慢释放进入人体，即孕激素引起的副作用，包括不规则的出血、点滴出血，或头晕、头痛、恶心，部分女性会产生情绪的变化。
上述副作用在刚开始放置避孕针时，会稍显严重，部分女性会因为无法坚持而要求取出。但随着时间推移，副作用会逐渐减低，不会影响效果，也能够逐渐耐受，此时避孕针即可长期埋入人体。为缓解孕激素引起的副作用，可以加用少量雌激素进行缓解。如果无法耐受，出现严重的副反应，则可适当取出。同时由于避孕针的副作用，导致皮埋避孕药的应用频率有所下降，但通常不会有过大影响。
