糖尿病有一部分情况和免疫系统疾病有关。一般常见的2型糖尿病，大部分和遗传、胰岛素抵抗、基因、环境有关，而一部分1型糖尿病和部分特殊类型的糖尿病和免疫系统有关。1型糖尿病的致病原因里很重要的组成部分就是自身免疫性疾病，此情况下和免疫有关，出现免疫破坏后即可引起此疾病，即胰岛素缺乏。还有部分特殊类型的糖尿病，此类特殊类型的糖尿病也有一部分还是和免疫系统有一定关系。
另外，部分免疫系统的疾病，如结缔组织病和自身免疫性疾病。在获得上述自身免疫性疾病的过程中，也有可能会破坏胰腺功能，出现血糖异常。此外，若在免疫系统的部分疾病治疗过程中，应用免疫调节药物，如免疫抑制剂，或在肿瘤的免疫治疗、运用糖皮质激素等，会出现继发性糖尿病，这种情况下也会出现血糖异常。
