尿疼痛的患者，首先需要警惕泌尿系统感染或膀胱尿道炎，建议在医院做简单的尿常规检查，如果提示白细胞水平增高，即可确诊为泌尿系统感染，需要应用针对性敏感抗生素进行治疗。
常用药物包括喹诺酮类抗生素，主要是沙星类药物，如诺氟沙星、氧氟沙星、莫西沙星等，除此之外还可以采用头孢二代抗菌素如头孢呋辛，及头孢三代抗菌素如头孢地尼等，还可选用尿液中浓度较高的呋喃妥因进行治疗。
除应用敏感抗生素外，还可以采用清热利湿的药物即中成药，常用中成药有癃清片、热淋清颗粒、泌淋清胶囊、银花泌炎灵片等，其本身具有清热利湿作用，而现代药理研究证实其对泌尿系统感染有较好的抗炎作用，能够辅助患者快速改善症状。
